Pavithra Prabhakar obtuvo su doctorado en Informática por la universidad de Illinois en Urbana-Champaign (UIUC) en 2011. Anteriormente había recibido un masters en Applied Mathematics por la misma universidad. Pavithra también tiene un masters en Informática por Indian Institute of Science, Bangalore y un título en informática por National Institute of Technology, Warangal, en India.
Pavithra se unió al profesorado investigador del Instituto IMDEA Software en 2011, pero disfrutó de una estancia investigadora en el California Insitute of Technology como Fellow del CMI (Center for Mathematics of Information), retrasando su incorporación definitiva a IMDEA a septiembre de 2012. Pavithra también ha realizado estancias durante varios veranos en los Bell-Labs en Murray Hill (NJ), trabajando en la síntesis formal de servicios web.
Pavithra ha recibido el previo Sohaib and Sara Abbasi por UIUC y la medalla M.N.S Swamy medal del Indian Institute of Science.
Su área de investigación es el análisis formal de sistemas cyber-físicos (Cyber-Physical Systems). Ha publicado extensivamente en conferencias sobre Hybrid Systems y Métodos Formales. Una contribución de Pavithra en HSCC ha recibido el premio de mención honorífica.